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技術(shù)文章

ctDNA提取試劑盒對血漿樣本長期儲存穩(wěn)定性影響的實驗研究

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  循環(huán)腫瘤DNA是來源于腫瘤細胞并釋放到血液中的核酸片段,因其具有非侵入性、實時反映腫瘤基因狀態(tài)等特性,在腫瘤早期診斷、療效監(jiān)測及預(yù)后評估等方面展現(xiàn)出巨大潛力。然而,血漿樣本的長期儲存可能導(dǎo)致ctDNA降解或損失,因此,選擇能有效保持ctDNA穩(wěn)定性的提取試劑盒至關(guān)重要。
 
  一、實驗方法與材料:
 
  本研究選取了市售主流的五種ctDNA提取試劑盒,并收集了一批來自不同腫瘤類型的患者新鮮血漿樣本,按照標(biāo)準(zhǔn)操作程序進行處理后,將其分為短、中、長期(如1個月、3個月、6個月、12個月)四個時間點進行冷凍保存。各時間點分別使用選定的試劑盒進行ctDNA提取,通過qPCR、ddPCR等技術(shù)檢測特定腫瘤相關(guān)突變基因的豐度。
 
  二、實驗結(jié)果與分析:
 
  實驗結(jié)果顯示,所有試劑盒在短期儲存血漿樣本中均能有效提取ctDNA,但在長期儲存條件下,部分試劑盒表現(xiàn)出優(yōu)異的性能,能夠保持ctDNA完整性,其提取效率僅輕微下降或無顯著變化。對比分析表明,含有特殊保護劑以及優(yōu)化的裂解、純化步驟的試劑盒,在長期儲存樣本中ctDNA的穩(wěn)定性和提取效果更佳。
 

 

  ctDNA提取試劑盒的選擇對于確保血漿樣本長期儲存后的ctDNA穩(wěn)定性具有直接影響。本研究揭示了某些ctDNA提取試劑盒在應(yīng)對血漿樣本長期儲存挑戰(zhàn)時所具備的優(yōu)勢,有助于指導(dǎo)未來臨床實踐和科研工作中ctDNA檢測方案的設(shè)計與實施。此外,為進一步提升ctDNA長期儲存的穩(wěn)定性,有必要繼續(xù)研發(fā)針對性更強、效果更優(yōu)的提取技術(shù)和試劑盒產(chǎn)品。
 
  后續(xù)研究可進一步探究血漿樣本儲存條件(如溫度、凍融次數(shù)等)與ctDNA穩(wěn)定性之間的具體關(guān)系,并結(jié)合生物信息學(xué)手段對提取出的ctDNA質(zhì)量進行深度評價,以推動ctDNA作為液體活檢標(biāo)志物在精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域更為廣泛而精確的應(yīng)用。
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